以下のコードで、カスタムタクソノミーを使ったカテゴリ一覧を表示できます。

<?php 
$terms = get_terms("taxonomy", "get=all&orderby=order");
if (count($terms) > 0) {
	foreach ($terms as $term) {
		$path = <ins datetime="2012-04-26T01:44:06+00:00">get_term_link($term->slug, "taxonomy");
		echo '<li><a href="'. $path .'">'. $term->name .'</a></li>';
	}
}
?>


参考:カスタム分類(TAXONOMY)のアーカイブリンクの取り方。